Nakon odluke o implementaciji mystery shoppinga sva preduzeća prolaze kroz određene 4 faze primjene koje ćemo u nastavku detaljnije opisati.
Ukoliko su preduzeća svjesna da su sve ove faze normalne i nužne, mystery shopping će se implementirati s još većim i bržim uspjehom.

Prva faza: Poricanje
Prva faza mnogih preduzeća koja prati pokretanje mystery shopping programa je poricanje – u smislu da se rezultati u maloj ili nikakvoj mjeri smatraju tačnima. U prvoj fazi česti su komentari "Nije moguće da se moj zaposlenik nije zahvalio kupcu. "Svi moji zaposlenici to sigurno rade. Subotom je uvijek gužva, pa nije ni mogao pozdraviti i slično." Kritike u ovoj fazi koncentrišu se oko menadžmenta, mystery shopping agencije, tajnih kupaca te odabranih scenarija i sadržaja upitnika. 

Druga faza: Prihvatanje
Prihvatanje rezultata mystery shoppinga kao istine obično zahtijeva provođenje nekoliko valova istraživanja. Menadžerima je vrlo jednostavno poreći rezultate pojedinačnog posjeta prodajnom mjestu racionalizirajući kako je "to bio loš dan", ili kako je riječ baš o "najgorem zaposleniku", no nakon ponovljenih posjeta uočavaju se pravilnosti u rezultatima bez obzira na vrijeme ili dan u sedmici kada je posjeta obavljena. Prihvatanje se može požuriti ukoliko menadžment jasno izražava ciljeve mystery shoppinga i ističe kako ga koristi kao alat za unapređenje kvalitete usluge, a ne sistem kažnjavanja, i terensko osoblje poput voditelja prodajnih mjesta ima mogućnost raspraviti dobijene rezultate i dobiti dodatne povratne informacije na svoje upite.
Nakon prihvatanja rezultata kao značajnih i korisnih, na prodajnim mjestima se mogu početi implementirati rješenja - od osnovne rasprave individualnih rezultata prodajnog mjesta s zaposlenicima do kompleksnog korporativnog treninga i programa usavršavanja. 

Treća faza: Primarne nagrade
Iako su možda poboljšani rezultati početni cilj, posebno nakon uključivanja poticaja jednom kad se radni učinak počne poboljšavati i kad se početni cilj usmjeri prema poboljšanju usluge nasuprot osvajanju nagrada, počinju se sticati prave pogodnosti ili primarne nagrade kao što su poboljšano zadovoljstvo kupaca (smanjenje broja pritužbi, povećani broj pohvala...), povećana prodaja, vanjske nagrade za kvalitetu usluge i slično. 

Četvrta faza: Kulturna indoktrinacija
Jednom kad preduzeće počne sticati spomenute nagrade, vidljiva je veza između mystery shopping programa, koji se koristio kao alat za poboljšanje, i dobivenih nagrada. Preduzeće na svim nivoima ne može više ni zamisliti rad bez mystery shoppinga niti vraćanje na prijašnji nivo radnog učinka. Ova faza poznata je pod nazivom kulturna indoktrinacija. Inostrana iskustva bilježe situacije da klijenti otkažu ili smanje mystery shopping zbog ograničenja budžeta da bi ih kasnije dočekali zahtjevi terenskih organizacija da ga ponovno uspostave.